1. 新型纳米探针的功能设计与生物医学影像应用，福建省自然科学奖，一等奖，2020年，获奖者：杨黄浩、李娟、刘刚、林立森、宋晓荣

2.  环境毒理研究的质谱新方法，2020年度中国分析测试协会科学技术奖（CAIA奖）特等奖，获奖者：蔡宗苇、林子俺、夏亦荠、洪燕君、朱林、赵超、邵晓剑、张海磊、张宏娜、张岩皓

3. 基于纳米材料形貌变化的可视化传感技术研究及应用，福建省科技进步奖一等奖，2019年，获奖者：林振宇、郭隆华、陈劲星、邱彬、翁齐彪、苏建峰、许梢华、陈国南

4. 天然蛋白源抗冻多肽的高效制备关键技术及产业化应用，福建省科技进步奖一等奖，2019年，获奖者：汪少芸、吴金鸿、蔡茜茜、陈旭、赵立娜、蔡晟、张恒、周红、付才力、马荣池

5. 食品源抗氧化肽制备关键技术及产业化应用，福建省科技进步奖二等奖，2017年，获奖者：汪少芸、付才力、吴小涛、蔡　晟、蔡茜茜、赵立娜、林振宇

6. 畜产品真实性精准鉴别和快速检测关键技术，湖北省科学技术发明二等奖，2020年，获奖者：刘榜、许文涛、王勤、林振宇，周翔、王文君

 7. 基于纳米材料的负离子LDI-MS分析小分子物质的研究，中国分析测试协会科学技术奖一等奖，2016年，获奖者：蔡宗苇、林子俺、卢明华、张建刚、路雯婧、杨雪清、王书娟、沈阳

8. 食品快检预处理技术与应用，福建省科技进步奖二等奖，2016年，获奖者：张兰、林志杰、汤新华、陈国南、刘薇、童萍、卢巧梅

9. 影像探针功能化设计与细胞/分子标记示踪，福建自然科学奖三等奖，获奖者：刘刚、杨黄浩、陈小元、许秀琴、王骁勇

10. 水产品质量安全监测、预警与控制关键技术研究，福建省科技进步奖三等奖，2015年，获奖者：邱彬、翁齐彪、林振宇、郭隆华、陈国南

11. 烤鳗鱼内脏产品开发及产业化，食品工业科学技术进步奖二等奖，2015年，获奖者：王家恩、翁齐彪、邱彬、林淑云、林振宇、汤敏英

12. 基于电化学与分子发光技术的化学与生物传感界面的构建及应用，福建省自然科学一等奖，2014年，获奖者：陈国南、杨黄浩、池毓务、孙建军、林振宇

13. 水产品身份追溯系统，福建省技术发明三等奖，2014年，获奖者：郭隆华、陈劲星、刘 臻、徐 佳、陈国南

14. 系列白羽鸡肉产品的产业化关键技术与应用；福建省科技进步奖三等奖，2014年，汪少芸、赵立娜、周红、陈明、宗瑜

15. 豆科植物种子中系列生物防御蛋白的研究，2013年，福建省自然科学奖二等奖，获奖者：汪少芸、叶秀云、饶平凡

16. 光电功能金属有机分子设计与调控，2013年，福建省自然科学奖，获奖者：陈忠宁、张礼仪、施林熙、魏巧华、徐海兵

17. 食品安全分析与检测新技术开发及其示范应用，2013年, 福建省科学技术进步二等奖，获奖者：陈国南、付凤富、张兰、邱彬、郭隆华、林子俺、林振宇

18. 藻类等海产品食物中砷的形态分析方法研究与应用，2012年, 福建省科学技术进步三等奖，获奖者：黄红霞、付凤富、郑小严、林松、徐两军

19. 快速检测光谱仪中前照式二维面阵CCD光电检测器的开发，福建省科学技术进步三等奖，2011年，获奖者：林振宇、陈国南、陈兵、余强、邱彬

20. 毛细管电泳化学发光PCR联用技术研究及其在转基因食品分析中的应用，2011年, 福建省科学技术三等奖，获奖者：邱彬、李小晶、吕水源、陈国南、林振宇、夏世飞、陈志涛

21. 蔬菜中农药、硝酸盐、亚硝酸盐和重金属残留的快速低成本检测仪器和方法研究，福建省科学技术一等奖，2005年，获奖者：陈国南、谢增鸿、黄文风、陈曦、庄峙厦、吴刚、蔡琪、黄敏、郭良洽、林旭聪